A Caixa Preta de Darwin (Darwins Black Box, no original) é um livro de Michael Behe, bioquímico e professor na Universidade de Lehigh.

O livro questiona a teoria da evolução das espécies de Charles Darwin como sendo antiquada para responder às surpreendentes descobertas que a ciência (especialmente o seu campo de estudo) tem feito nos últimos anos. O texto analisa, à luz da bioquímica, os argumentos usados por Darwin e outros evolucionistas para justificar a teoria da evolução pelo mecanismo de seleção natural, mostrando que muitos processos biológicos não poderiam ter evoluído por um processo lento, gradativo e não teleológico como Darwin pensava. Seriam "irredutivelmente complexos". Ele é um dos principais líderes do movimento do Design Inteligente (movimento que, levado pelo peso das evidências, defende a idéia de que a vida é complexa demais para ter surgido ao acaso). O autor não descarta a ancestralidade comum universal dos seres vivos.